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肝內膽管癌（Intrahepatic Cholangiocarcinoma，ICC）是僅次于肝細胞肝癌的第二大常見(jiàn)原發(fā)性肝惡性腫瘤，近年來(lái)發(fā)病率呈增長(cháng)趨勢，具有起病隱匿、高度侵襲、高度異質(zhì)、預后不良等特點(diǎn)。其中，起病隱匿、高異質(zhì)性是影響肝內膽管癌靶向及免疫治療效果的重要因素。為解析肝內膽管癌發(fā)展不同時(shí)期腫瘤組織內部的動(dòng)態(tài)異質(zhì)性，西安交通大學(xué)電信學(xué)部自動(dòng)化學(xué)院葉凱教授與華中科技大學(xué)李蕾教授團隊建立肝內膽管癌小鼠模型，采集時(shí)序單細胞轉錄組數據，整合多維組學(xué)數據，分析驗證了調控腫瘤異質(zhì)性的關(guān)鍵調控網(wǎng)絡(luò )、早期起源細胞、關(guān)鍵驅動(dòng)基因、內皮纖維細胞在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的動(dòng)態(tài)相互作用。
研究發(fā)現在肝內膽管癌腫瘤細胞中存在應激反應和增殖性腫瘤亞型。使用基因共表達、圖網(wǎng)絡(luò )挖掘等機器學(xué)習方法首次發(fā)現兩種腫瘤亞型中異質(zhì)性的轉錄因子及調控網(wǎng)絡(luò )。首次發(fā)現并驗證肝臟內部上皮細胞從分化到癌化過(guò)程中的關(guān)鍵驅動(dòng)基因，并首次發(fā)現頂端內皮細胞在響應纖維細胞刺激的同時(shí)促進(jìn)纖維細胞的重塑，最終促進(jìn)腫瘤細胞增殖的動(dòng)態(tài)過(guò)程及分子機制。本研究報道的多種關(guān)鍵細胞類(lèi)型和驅動(dòng)基因提升了領(lǐng)域對肝內膽管癌的發(fā)病機制及瘤內異質(zhì)性的認識，為診斷和治療提供了新的靶點(diǎn)。
該項研究工作依托于西安交通大學(xué)醫學(xué)部第一附屬醫院?jiǎn)渭毎麥y序平臺，Med-X研究院數字醫學(xué)研究所，電子與信息研究院生物信息學(xué)研究所三個(gè)干濕結合平臺。研究成果以“基于單細胞轉錄組的肝內膽管癌起始發(fā)展細胞異質(zhì)性研究”（Cellular heterogeneity and transcriptomic profiles during intrahepatic cholangiocarcinoma initiation and progression）為題發(fā)表在《肝病學(xué)》。西安交通大學(xué)為該論文第一作者單位，西安交通大學(xué)電信學(xué)部自動(dòng)化學(xué)院王庭杰博士生與華中科技大學(xué)徐傳瑞教授為文章共同第一作者。葉凱教授為末位通訊作者，李蕾教授為該論文共同通訊作者。
